作为全球基因行业的引领者和奠基者,华大基因用自己的实力在这个领域站稳了脚跟。
3月29日,华大基因唐冲博士团队于基因组学顶级期刊Genome Biology发表重要科学论文“BIND&MODIFY: a long-range method for single-molecule mapping of chromatin modifications in eukaryotes”。华大基因唐冲博士团队在文章中介绍了一种基于构建葡萄球菌蛋白A-甲基转移酶融合重组蛋白,对抗体结合的组蛋白修饰、DNA结合蛋白附近的DNA进行特异性定点甲基化修饰,并通过长读长测序获得高精度的、DNA单分子水平上的组蛋白修饰及DNA结合蛋白序列信息。
其实早在之前,华大基因就在这个领域展开了研究,但他们在研究的过程中一直觉得传统的方法似乎已经不适合了,因为传统的研究并不能展现出每一个大片段DNA分子上蛋白结合的真实状态。
华大基因唐冲博士团队于基因组学顶级期刊Genome Biology发表重要科学论文
ChIP-seq、CUT&Tag等都是常见的研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具,传统的基于ChIP-seq的蛋白-DNA互作研究方法利用抗体免疫沉淀后富集的打断后的DNA片段短读长测序并进行peak calling,反映了特定DNA位点的蛋白结合平均状态信息。但这些传统方法无法获得每一个大片段DNA分子上蛋白结合的真实状态,无法进行DNA复杂结构域蛋白-DNA交互作用的分析,使得蛋白-DNA交互作用在单分子水平上的研究受到限制。也正是在这种情况下,华大基因在蛋白-DNA交互作用技术方面作出了升级,升级后的蛋白-DNA交互作用通过对不打断的大片段DNA分子进行特异性甲基化标记,能利用长读长测序,获得高精度、DNA单分子水平上的组蛋白修饰、DNA结合蛋白序列信息,同时获得DNA单分子异质性、CpG甲基化多组学、复杂结构域的蛋白-DNA互作等信息。因此,该结果一经公布就受到了业内人士的高度关注。目前,华大基因唐冲博士团队正在对BIND&MODIFY技术进行优化,针对更多与人类疾病相关的蛋白-DNA交互作用进行系统分析,为后续新型药物靶点发现提供基础。
华大基因蛋白-DNA交互作用技术流程图
未来,华大基因也会继续秉持着“基因科技造福人类”的理念,不断推出更多的基因检测服务,把基因科技惠及更多的群众。
|
